O DeepMind é mais conhecido pela IA que derrotou facilmente os melhores jogadores de Go e StarCraft II do mundo nos últimos anos. O laboratório de pesquisa pertencente à Alphabet agora está aplicando seu trabalho existente para ajudar os pesquisadores a combater o COVID-19.
Para testar um vírus e desenvolver uma vacina, os cientistas devem primeiro entender como ele funciona, especificamente a estrutura das proteínas virais. É um processo demorado que leva meses e nem sempre produz resultados. Pesquisadores nos últimos anos se voltaram para previsões de computador, com o sistema de aprendizado profundo do DeepMind conhecido como AlphaFold.
O trabalho com o coronavírus está em andamento em laboratórios ao redor do mundo. A DeepMind espera ajudar essa pesquisa “liberando previsões de estrutura de várias proteínas não estudadas associadas ao SARS-CoV-2, o vírus que causa o COVID-19. “
Enfatizamos que essas previsões de estrutura não foram verificadas experimentalmente, mas esperamos que possam contribuir para o interrogatório da comunidade científica sobre como o vírus funciona e servir como uma plataforma de geração de hipóteses para futuros trabalhos experimentais no desenvolvimento de terapêuticas.
A equipe observa rapidamente que os dados compartilhados hoje “não são o foco principal dos esforços terapêuticos atuais”, mas podem ajudar no entendimento geral. Existem várias outras advertências, com o DeepMind fornecendo índices de confiança e combatendo apenas proteínas que são um desafio para as abordagens de modelagem convencionais.
É importante observar que nosso sistema de previsão de estrutura ainda está em desenvolvimento e não podemos ter certeza da precisão das estruturas que estamos fornecendo, embora tenhamos certeza de que o sistema seja mais preciso que o sistema CASP13 anterior. Confirmamos que nosso sistema forneceu uma previsão precisa para o SARS-CoV- determinado experimentalmente2 estrutura de proteína de pico compartilhada no Banco de Dados de Proteínas, e isso nos deu confiança de que nossas previsões de modelo sobre outras proteínas podem ser úteis.
De acordo com a DeepMind, foi encorajado a compartilhar sua pesquisa com o COVID-19 com a comunidade científica em geral, depois de consultar biólogos estruturais e virologistas no Reino Unido.
Normalmente, esperaríamos para publicar este trabalho até que ele fosse revisado por um periódico acadêmico. No entanto, dada a seriedade potencial e a sensibilidade temporal da situação, estamos liberando as estruturas previstas como as temos agora, sob uma licença aberta, para que qualquer pessoa possa usá-las.
Pesquisadores interessados podem baixar as estruturas aqui e ler mais detalhes técnicos sobre essas previsões em um documento incluído com os dados.